第一百八十三章 老裘,你的病就有救啦！(5.4K)（2 / 3）

藻类等在内，总数大约有两百多万。

至于未被发现的数量就更多了，并且波动很大。

众所周知。

目前推测生物种数一共有两类方法：

一类是直接请分类学专家通过理论推算，评估世界上可能还有多少物种待发现。

另一类方法是根据已详细调查区域的物种数量，外推至全球的总物种数。

然而，这些方法有许多假设与限制，使得推算的总物种数差异甚大。

最低的推算数值是三百万，最高的甚至达到了一个亿。

目前接受度比较高的一个数字，是由夏威夷大学马诺阿分校ora教授提出来的：

870万，不包括病毒。

他是应用生物分类阶层——也就是生物课本里学过的界门纲目科属种的数量趋势，推估出出来的这个数字（/t/113/21/5970）

例如某动物门=10纲=100目=1000科=10000属=100000种，同时不同类群的分类阶层数量有相似的趋势，且高阶分类相对于种较稳定。

因此经过一系列的模拟，最终可推估得到较可信的总物种数。

ora教授的这篇论文是目前全球被引用次数最多的统计文稿之一，也算是个比较权威的推论了。

870万对比200万。

因此在青苔之中发现某种甚至多种微生物的存在，徐云真的一点儿都不惊讶。

随后他沉思片刻，对裘生道：

“老裘，先做16S相似度检测吧。”

裘生点点头，飞快的带上套...手套，说道：

“行，我立马就做。”

一般来说。

如果是培养皿培育出的菌株，检测或者对比的难度往往都不高。

但对象若是自然界富集的样本，操作起来就比较麻烦了。

徐云所说的16S相似度检测，指的是核糖体小亚基的RNA组分检测。

也就是16SrRNA。

这部分长度大约1500nt，不同物种略有差异，算是目前主流的九大新物检测步骤之一。

五分钟后。

裘生抬起头，对徐云道：

“老徐，准备好了，引物你觉得用啥？”

徐云想了想，很快道：

“1492R吧。”

“好嘞！”

半个小时后。

裘生抬起头，打了个响指：

“搞定，扩出来了，BLAST的密匙你有吧？”

徐云朝他竖起一根大拇指示意干得漂亮，随后走到操作台边，噼里啪啦的输了一大串密匙。

做过新种检测的同学应该都知道。

16S相似度检测的界限其实有些模糊，因为不同分类群的检测相似度阈值是不一样的。

比如有的是97%，有的是99%。

只是在通常情况下。

相似度超过97%的，就可以认为是一个物种。

相似度低于97%的，就可以认为是不同物种，进行下一阶段检测。

不过就是这样一种不太精细的检测手段，却依旧是很多新物检测迈不过去的一道坎：

大部分样本在经过检测之后，都会发现相似度在99.99%以上，与其他某某微生物是同一物种。

总而言之。

这项技术在定属方面还是靠谱的。

又过了一会儿。

裘生一脸惊喜的抬起头，声音骤然拔高了几分：

“老徐，相似度46.9%，46.9%！！”

“毫无疑问，这是一类新物！”

徐云认真的看了他一眼，确认道：

“只有一种新物吗？”

“没错，只有一种！”

徐云若有所思的点点头，又道：

“那就继续上磷脂脂肪酸和呼吸醌鉴定吧。”

众所周知。

新物鉴定一般都有九个流程：

1、16S相似度。

2、形态学观察。

比如这个菌的形状、大小、鞭毛情况等等，还包括最适生长条件的确定。

3、磷脂脂肪酸鉴定，这个具有属特异性。

4、呼吸醌，也就是看一下占优势的呼吸醌是哪种，这个有种特异性。

5、分子杂交，也就是测定基因组序列，草图就行，然后跟近源物种去比较。

相似度超过70%是一个种，低于70%是不同物种。

6、碳源利用情况，看一下能利用哪些碳源，一共有95种碳源的测试。

7、API试剂盒鉴定，生理生化鉴定的一方面。

8、GC含量。

9、革兰氏染色。

大概经过这些方面的检查，就可以确定是不是新种了。（注：不知道这样写的比